Dat maakt niet uit. Dat bepaal je uiteindelijk met de functie move_uploaded_file() en je kunt voor elk bestand afzonderlijk dus een verschillende locatie opgeven.
Als je het niet probeert lukt het zeker niet. In mijn eerste post in dit topic heb ik je al een beknopt stappenplan gegeven, aan de hand daarvan kun je dus e.e.a. gaan uitzoeken.