Ja, via de [php]exec[/php] functie. Zodra je had gezocht op [google]bash script in php[/google] krijg je duizenden resultaten en uitleg...
Ook met tekst tussen `` (backtricks) kun je uitvoeren als bash script:
<?php
// voorbeeldje in combinatie met rails, weet even zo snel geen ander bash scriptje
`rails new Blog`
?>